エラーバー付きのグラフ ggplot2
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簡単なエラーバーの描き方
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比較した箱ひげにアスタリスクを入れる
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sample
解析の練習で使うデータサンプル集 随時更新
sample1
症例 <- c(1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20) 性別 <- c("男性","男性","女性","男性","男性","女性","男性","男性","男性","男性","女性","女性","女性","女性","男性","女性","女性","女性","女性","男性") 治療 <- c("B","A","B","A","A","B","B","A","A","B","A","B","B","B","A","B","B","B","A","A") 治療前BP <- c(160,135,177,141,142,155,175,145,149,155,135,156,170,150,138,160,150,180,155,140) 治療後BP <- c(148,133,160,138,139,145,157,142,142,145,132,145,157,142,134,150,140,160,149,136) BP変化量 <- c(12,2,17,3,3,10,18,3,7,10,3,11,13,8,4,10,10,20,6,4) sample1 <- data.frame(症例,性別,治療,治療前BP,治療後BP,BP変化量 )
sample2
対応のある2群
ID <- c(1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10) pre <- c(18, 8, 14, 15, 16, 13, 23, 20, 14, 20) post <- c(23, 27, 15, 22, 15, 20, 20, 20, 18, 25) sample2 <- data.frame(ID, pre, post)
sample3
独立した2群
グループ <- c("A","A","B","B","A","B","A","B","B","A","A","A","B","A","B","B","B","B","A","A") ROMT <- c(18, 8, 23, 27, 14, 15, 15, 22, 15, 16, 13, 23, 20, 20, 20, 20, 18, 25, 14, 20) sample3 <- data.frame(グループ, ROMT)
sample4
クロス表
sample4 判定 <- c(rep("非該当",30), rep("要支援", 25)) 歩行 <- c(rep("可能", 20), rep("不可能", 10), rep("可能", 10), rep("不可能", 15)) sample4 <- data.frame(判定, 歩行)
テーブルをベクトルに変換
症例 性別 治療 治療前BP 治療後BP BP変化量 1 1 男性 B 160 148 12 2 2 男性 A 135 133 2 3 3 女性 B 177 160 17 4 4 男性 A 141 138 3 5 5 男性 A 142 139 3 6 6 女性 B 155 145 10 7 7 男性 B 175 157 18 8 8 男性 A 145 142 3 9 9 男性 A 149 142 7 10 10 男性 B 155 145 10 11 11 女性 A 135 132 3 12 12 女性 B 156 145 11 13 13 女性 B 170 157 13 14 14 女性 B 150 142 8 15 15 男性 A 138 134 4 16 16 女性 B 160 150 10 17 17 女性 B 150 140 10 18 18 女性 B 180 160 20 19 19 女性 A 155 149 6 20 20 男性 A 140 136 4
上記テーブルの性別を切り出し
テキスト形式のベクトルに変換
data <- read.table("clipboard", header = T) 性別2 <- factor(data$性別) install.packages("stringr") library(stringr) 性別3 <- str_replace_all(性別2, pattern="k", replacement="*") #性別3をwordで置換 スペースを,に変換 性別 <-c("男性","男性","女性","男性","男性","女性","男性","男性","男性","男性", "女性","女性","女性","女性","男性","女性","女性","女性","女性","男性")
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PDFのファイル名はNo1,No2,No3の三枚
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\documentclass[uplatex,11pt]{jsarticle} \usepackage[top=15truemm,bottom=15truemm,left=15truemm,right=15truemm]{geometry} %余白 %図 \usepackage[dvipdfmx]{graphicx} %図の位置調整 改行後に[H] \usepackage{here} % 章が進むごとに図番号をリセットする \makeatletter% プリアンブルで定義開始 \renewcommand{\thefigure}{\arabic{figure}} \@addtoreset{figure}{section} \makeatother % プリアンブルで定義終了 %図とキャプションを狭くする \setlength\abovecaptionskip{5pt} %---------------------------------------------------% \begin{document} %---------- 1 ----------% \begin{figure}[H] %現在の位置に \centering \includegraphics[width=17cm]{No1.pdf} %図の挿入 \end{figure} %---------- 2 ----------% \newpage \begin{figure}[H] %現在の位置に \centering \includegraphics[width=17cm]{No2.pdf} %図の挿入 \end{figure} %---------- 3 ----------% \newpage \begin{figure}[H] %現在の位置に \centering \includegraphics[width=17cm]{No3.pdf} %図の挿入 \end{figure} \end{document}
